محققان دانشگاه شهید چمران اهواز موفق به اجرای مطالعات طراحی هدفمند پپتید مهارکننده آنزیم پروتئاز اصلی کویید-۱۹ با استفاده از مهارکنندههای حشرات و گیاهان شدند.
به گزارش اداره کل روابط عمومی وزارت علوم به نقل ازدانشگاه شهید چمران اهواز، دکتر سید علی همتی عضو گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز در این خصوص اظهار داشت: کروناویروسها، ویروسهای آلودهکننده سیستم تنفسی انسان و حیوانات است و بیماریهایی از قبیل سرماخوردگی معمولی تا بیماریهای تنفسی حاد را ایجاد میکند.
وی افزود: تاکنون هفت گونه کروناویروس عفونتزا در انسان ردیابی شده است که آخرین مورد آن کروناویروس عامل COVID-۱۹ است که در اثر گسترش این ویروس در بیش از ۲۰۰ کشور جهان بیش از ۱۱ میلیون نفر به این بیماری مبتلا شدهاند.
دکتر همتی با اشاره به اینکه تا امروز هیچ گزینه درمانی مؤثری برای این بیماری ارائه نشده است، گفت: یکی از رویکردهای مؤثر در روند کشف سریع ترکیبات مطلوب برای درمان این بیماری، بررسی اثر مهارکنندههای پروتئازی مختلف با منشأ طبیعی بر روی فعالیت آنزیم پروتئاز است.
عضو هیئتعلمی دانشگاه شهید چمران اهواز ادامه داد: بر این اساس با استفاده از مطالعات محاسباتی اثرات و توان مهارکنندههای حشرات و گیاهان برای مهار آنزیم پروتئاز اصلی ویروس کرونا در این دانشگاه بررسی شد و در گام نخست کار غربالگری میان مهارکنندههای متعدد با استفاده از سرورها و نرمافزارهای تخصصی آغاز شد تا با دستیابی به گزینهی مناسب، طراحی پپتید مهارکننده با کارآیی مطلوب صورت پذیرد.
وی ادامه داد: پس از غربالگری توانستیم با توجه به پنج گزینهی مطلوب شامل مهارکنندههای پروتئازی برگرفته از حشرات ملخ مهاجر، کرم غوزهی پنبه و شبپره هندی و همچنین گیاهان سیبزمینی شیرین با استفاده از وبسایتهای مربوط و بر اساس اختلاف سطوح در دسترس اسیدآمینههای جایگاه عملکردی آنزیم پروتئاز اصلی کروناویروس در میانکنش با مهارکنندههای مذکور، پپتیدهای مهارکننده طراحی کنیم.
وی افزود: در گام بعد، توانمندی پپتیدهای طراحیشده به عنوان مهارکنندههای مختلف در میانکنش با جایگاه عملکردی آنزیم پروتئاز اصلی بیمارگر با استفاده از شبیهسازی داکینگ مولکولی بررسی شد. بر اساس این نتایج، روشن شد که پپتید مهارکننده حاصل از سیبزمینی شیرین و کرم غوزهی پنبه دارای مطلوبترین ویژگیها شامل بهترین امتیاز داکینگ، کمترین مقدار Z-score، کمترین میزان تغییرات RMSD و منفیترین انرژی پیوند کل در میانکنش با جایگاه عملکردی آنزیم پروتئاز اصلی عامل COVID-۱۹ هستند و درنتیجه قادر به توقف فرآیند بیماریزایی ویروس خواهند بود که میتوانند بهعنوان گزینههای مناسب برای سنتز و بررسیهای آزمایشگاهی و بالینی بیشتر، معرفی شوند.